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警告:新冠已变异成三种毒株!且还在快速突变!英科学家从居武汉美国人身上检测到突变的“ A”型病毒?

PNAS 剑桥大学 灸灸健康 2020-10-11
核心提示:来自英国剑桥和美国国家科学院的最新消息显示,英国的研究人员已经通过基因网络技术重建了人类中COVID-19的早期“进化途径”。告病毒已经发生变异……

来自英国剑桥和美国国家科学院的最新消息显示:英国的研究人员已经通过基因网络技术重建了人类中COVID-19的早期“进化途径”。

通过分析从人类患者身上测序的前160个完整病毒基因组,科学家们绘制了新冠状病毒通过其突变产生的原始谱系,从而产生了不同的病毒谱系。

发现“有太多的快速突变,无法完整追踪COVID-19家族树。我们使用了数学网络算法来同时可视化所有的可能。”剑桥大学的遗传学家彼得·福斯特博士说。 

“这些技术最开始的是通过DNA绘制史前人类的移动图。我们认为这是它们首次被用来追踪冠状病毒(例如COVID-19)的感染途径。” 

该团队使用了2019年12月24日至2020年3月4日从世界各地采样的病毒基因组中获得的数据。研究发现,COVID-19的三个不同“变体”由紧密相关的血统簇组成,他们将其标记为“ A”,“ B”和“ C”。

图片来源美国国家科学院

福斯特和他的同事发现,武汉发现了与蝙蝠中最接近的COVID-19类型-“ A”型,即“原始人类病毒基因组”,但令人惊讶的是,它不是该城市的主要病毒类型。

据报道,从居住在武汉的美国人身上测到了突变的“ A”型病毒,在美国和澳大利亚的患者中发现了大量的A型病毒。

武汉的主要病毒类型“ B”在整个东亚患者中普遍存在。不过,研究人员说,该变体没有进一步的突变就不会在该地区以外传播很多。

“ C”变体是主要的欧洲类型,在法国,意大利,瑞典和英国的早期患者中发现。该研究在中国大陆样本中没有,但在新加坡,香港和韩国见过。

新的分析还表明,最早是在1月27日将这种病毒引入意大利,这是通过首次有记载的德国感染而引起的,而另一种早期的意大利感染途径则与“新加坡群”有关。

重要的是,研究人员说,他们的遗传网络技术可以准确地追踪既定的感染途径:突变和病毒谱系在已知病例之间相互交织。

因此,科学家认为这些“系统发育”方法可以应用于最新的冠状病毒基因组测序,以帮助预测未来疾病传播和激增的全球热点。

“系统进化网络分析有潜力帮助识别未记录的COVID-19感染源,然后可以对其进行隔离以遏制该病在全球的进一步扩散,”考古研究所研究员福斯特说。


图片来源:美国国家科学院

该发现今天发表在《美国国家科学院院刊》(PNAS)上。该研究中使用的软件以及1000多种冠状病毒基因组的分类和计数可从www.fluxus-technology.com免费获得。   

研究人员发现变种“ A”与蝙蝠和穿山甲中发现的病毒最密切相关,称其为“爆发的根源”。类型“ B”源自“ A”,被两个突变分隔,然后“ C”又是“ B”的“女儿”。

研究人员说,“ B”变体在东亚的本地化可能是由“奠基者效应”造成的,福斯特认为,还有另一种值得考虑的解释。B型病毒可以在免疫学或环境方面适应东亚大部分人口。在初始阶段,我们似乎看到东亚的突变率比其他任何地方都慢。

他补充说:“我们详细描述的病毒网络是流行早期的快照,当时COVID-19的进化路径被大量突变所掩盖。就像在行动中捕捉到了一颗超新星。”

自从进行PNAS研究以来,研究团队已将其分析扩展至1,001个病毒基因组。尽管尚未经过同行评审,但福斯特说,最新研究表明,COVID-19的首次感染和传播是在9月中旬至12月初之间发生的。 

研究人员使用的系统进化网络方法-可以在一幅简单的图中同时显示数百棵进化树-于1979年在新西兰开创,然后由德国数学家在1990年代开发。

这些技术引起了考古学家Colin Renfrew教授的注意,他是PNAS这项新研究的合著者,于1998年提出。

(文章来源:剑桥大学 美国国家科学院)


编后:这是小编从剑桥大学和美国国家科学院官网上采集到的信息,某些翻译可能存在偏差。新冠病毒已经给世界带来了巨大的恐慌与损失,全世界科研机构和科学家都在追根溯源并努力寻求解决方法,让我们以谦卑的态度善待世界,相信科学,心怀希望!



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